Зилаи́рский райо́н (баш. Йылайыр районы) — административно-территориальная единица (район) и муниципальное образование (муниципальный район) в её границах под наименованием муниципальный район Зилаирский район (баш. Йылайыр районы муниципаль районы) на юго-востоке Республики Башкортостан Российской Федерации.
Административный центр: село Зилаир.Площадь района составляет 5774 км². Район граничит с Баймакским, Бурзянским, Зианчуринским, Кугарчинским и Хайбуллинским районами Республики Башкортостан. Расположен в южной части башкирского Урала. Территория района находится в пределах Зилаирского плато, прорезанного каньонообразующими долинами рек Баракал, Зилаир, Большой Сурень и верховьями Большого Ика: реками Авашлой, Бердяш, Текалью. Распространены берёзово-сосновые леса, переходящие на западной окраине района в дубовые, на юго-восточной окраине — в берёзовые и сосновые. Почвы: горные чернозёмы, горно-лесные серые и чернозёмы, на востоке чернозёмы обыкновенные.